そんな「トラブル」はない
かぶってなくても叩く人は叩きます
ちょっとショートショートと似てたぐらいで取り下げられる作品が実在するのがむしろ不思議です
一方、本当に致命的なもの、たとえば二次創作が後から公式とかぶるようなパターンは、それを覚悟してから作り始めるしかないです